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现代榴莲基因组研究获突破

发布日期:2018/11/22 19:11:52 浏览:364

来源时间为:2018-11-19

华北理工大学王希胤课题组对现代榴莲基因组的研究取得新突破。研究论文近日在线发表于《植物生理学》。

课题组重新分析了榴莲基因组,并与棉花、可可、葡萄基因组进行比较,发现榴莲基因组的构成源于一次独有的六倍化事件,以及一次与其他双子叶植物共有的更古老的六倍化事件。

完整的榴莲基因组测序曾于2017年发表,提出榴莲和棉花共享基因组加倍事件,但并未明确多倍化事件的性质和规模。榴莲基因组公布后,王希胤课题组以葡萄、可可树为外类群,重新分析了榴莲和与其进化上相近的棉花基因组。课题组利用提出的植物复杂基因组软件流程,进行了基因组间同源基因点阵图分析、共线性基因与相关进化事件的联合分析、共线性基因构树分析和榴莲—棉花共线性基因的共有分析等。

研究发现,除双子叶植物共有的近1.3亿年前的六倍化事件之外,榴莲和棉花又各自经历了一次独立的多倍化事件。榴莲基因组经历了一次古六倍化事件,大约发生在2100万年前~1900万年前。而棉花基因组经历的是一次古十倍化事件,约发生在1400万年前~1300万年前。

研究指出,棉花基因组经历古十倍化事件后进化速率加快,使棉花基因的进化速率相对榴莲提高了约64。而榴莲的古六倍体事件并未显著提高榴莲基因组的进化率,这可能与榴莲生命周期较长有关。

相关论文信息:DOI:10.1104/pp.18.00921

《中国科学报》(2018-11-19第4版综合)打印发E-mail给:以下评论只代表网友个人观点,不代表科学网观点。

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